Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms