Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms