Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BEST3Q8N1M1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST3Q8N1M1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms