Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBRM1Q86U86 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms