Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTF1AQ7RTS3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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