Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNDC1Q76NI1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms