Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms