Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms