Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf140Q5VVS0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms