Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC01545Q5VT33 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms