Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEX3CQ5U5Q3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms