Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms