Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms