Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP170Q5SW79 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms