Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHYHD1Q5SRE7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHYHD1Q5SRE7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms