Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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