Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms