Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms