Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN2Q52LD8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms