Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MICAQ29983 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MICAQ29983 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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