Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RTL8BQ17RB0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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