Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms