Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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