Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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