Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USF2Q15853 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USF2Q15853 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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