Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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