Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms