Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms