Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRIP13Q15645 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRIP13Q15645 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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