Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
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