Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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