Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A1Q14973 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms