Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms