Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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