Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms