Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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