Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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