Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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