Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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