Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms