Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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