Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNL1Q0VF96 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms