Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms