Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms