Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms