Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRKCDQ05655 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms