Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIN1Q05586 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms