Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SSBP1Q04837 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms