Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms