Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms